孔子博物馆前身是曲阜市孔子博物院，主要承担征集、收藏孔子及儒家相关的各类文物，开展相关文物的研究、保护和利用，开展文物展示、宣传教育、文化交流，弘扬以儒家思想文化为代表的中华优秀传统文化，以建设孔子思想和儒家文化收藏中心、研究中心、传播中心为发展目标的历史文化类博物馆。孔子博物馆现有文物藏品34类，共计358870件/套，主要源于孔府旧藏，包含孔府档案、古籍图书、祭孔礼乐器、明清至民国服饰以及大量陶器、玉器、瓷器、家具、石刻、碑帖拓片等。孔子博物馆紧扣时代命题，从文化战略和国家形象的高度，打造基本陈列《大哉孔子》和《孔府旧藏文物珍品展》，《大哉孔子》集中展示了孔子的时代、孔子的一生、孔子的智慧、孔子与中华文明、孔子与世界文明等五个部分，《孔府旧藏文物珍品展》主要展出了孔府旧藏祭祀礼乐器、孔府私家文书档案以及传世明清服饰等，集中展示千年孔府的历史传承。孔子博物馆核定事业编制160名，目前单位实有从业人员394人，在编人数104人，设馆长1名，副馆长1名，专职副书记1名。孔子博物馆消防工程严格按照各类消防规范，设计安装了气体灭火系统、预作用式自动喷水灭火系统、极早期火灾探测系统等。并根据国家、省、市法律法规精神，结合本馆实际，先后制定了《消防安全责任制实施细则》《消防应急预案》等安全管理制度。孔子博物馆将继续为实现中华优秀传统文化创造性转化、创新性发展作出新的贡献。